martes, 21 de febrero de 2012

Algoritmo de Google Pagerank Usado Para Modelar Enlaces de Hidrógeno en Agua


Una investigadora de la Universidad Estatal de Washington ha encontrado una aplicación inusual para el algoritmo empleado para determinar el Pagerank de Google. La científica llamada Aurora Clark, usó este algorítmo para analizar los enlaces de hidrógeno en el agua. De esta manera, al conectar el campo de la computadora con la química, su proyecto busca predecir la reactividad química entre partículas de forma distinta sin pasar por la molestía y gasto de efectuar experimentos de laboratorio.
El agua juega un rol crucial en todos los procesos biológicos y sus partículas pueden interactuar con otras partículas de maneras demasiado complejas como para medirlas con facilidad, por ejemplo cuando ayuda a las proteínas a plegarse o cuando actúa como solvente. De hecho, estos procesos son tan complejos como las interacciones entre múltiples dominios en la web.

Al llevar esta analogía al extremo, Clark rediseñó el software del Pagerank de Google para crear moleculaRnetworks, un modelo que permite a los científicos decidir que conexiones químicas son más probables que ocurran entre moléculas con formas distintas por medio de la predicción de la "popularidad" de enlaces particulares.

Lo que resulta más interesante de este proyecto que es que toma tecnología de un campo de la ciencia totalmente separado como es la conputación y lo aplica al entendimiento del mundo natural.

La fortaleza del algoritmo del Pagerang desarrollado por Larry Page y Sergey Brin cuando eran estudiandos de la Universidad de Stanford se da en el hecho de que es capaz de analizar una gran porción de todas las conexiones de la Web al mismo tiempo. Las interrelaciones entre páginas web están en flujo constante ya que dependen de un número incontable de factores que cambian a través del tiempo. De forma similar, las moléculas de aguas se comportan de una manera que resiste la descripción estática. Aplicando el principio del Pagerank, es posible visualizar patrones que de otra manera hubiesen pasado desapercibidos.

 Si bien este enfoque no eliminará la necesidad de efectuar pruebas de laboratorio, podrá ayudar a los científicos a elaborar hipótesis que posteriormente pueden comprobarse en el laboratorio. Estas son noticias bastante importantes para científicos que deben trabajar con materiales químicos venenosos o radioactivos. El proyecto también ofrece beneficios potenciales en el campo del diseño de drogas.





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